目前大多數(shù)農(nóng)藥為有機化合物和無機化合物，其物理性能和化學性能因藥而異，比較復雜。農(nóng)藥能夠進行合理的保管，能夠減少因農(nóng)藥中毒、爆炸等時間的發(fā)生，在保管過程中，必須注意以下幾點：
1、注意存放地點。存放農(nóng)藥的房屋，必須做到離糧倉、飼料房、牲畜棚圈盡可能遠一些，防止污染和相互影響，也不宜與化肥同放，因為化肥和農(nóng)藥的種類都很多，性質(zhì)各異，存放一起會發(fā)生化學反應，導致質(zhì)變或失效。如碳酸氫銨當氣溫達到攝氏30度時會分解，釋放出氨氣，氨氣在潮濕的條件下化合成堿性較強的氫氧化銨，可使遇堿分解的農(nóng)藥降低藥效。同時各種性質(zhì)（即通常農(nóng)藥分堿性、中性和酸性）不同的農(nóng)藥要分開存放。
2、注意存放溫度。存放農(nóng)藥的溫度不能過高過低，一般在攝氏30度以上的溫度條件下，溫度越高，農(nóng)藥越容易融化、分解、揮發(fā)，甚至燃燒爆炸；溫度太低對農(nóng)藥也有不利的影響，如有些液體農(nóng)藥，在攝氏0度以下就會結冰，使農(nóng)藥的藥效降低。因此，保存農(nóng)藥，夏天要防止高溫，冬天要防止低溫。
3、注意存放濕度。有些農(nóng)藥，如可濕性粉劑等，容易吸潮，吸濕后變成硬塊，一來使用的時候比較費事，二來會變質(zhì)失效，紙包裝的農(nóng)藥受潮后容易破裂，不僅不好搬運，還會污染周圍環(huán)境。
4、注意長時間暴露。農(nóng)藥長時間暴露在空中和陽光下，容易揮發(fā)和發(fā)生氧化作用等，引起質(zhì)變。如辛硫磷見光易分解、變質(zhì)。一般固體農(nóng)藥要包裝嚴密，液體農(nóng)藥要用有色瓶子或罐子盛裝。總之不管是固體還是液體農(nóng)藥，都不能直接在陽光下曝曬，要把農(nóng)藥放在陰涼、干燥處密閉保存。
5、注意遠離火源。藥庫或藥箱要遠離火源，尤其是瓶裝農(nóng)藥要嚴密封口，防止毒氣揮發(fā)、燃燒，以免引起人畜中毒。
在保存期間都有特殊的要求，應嚴格按使用保管要求管理，如保存條件不適宜，農(nóng)藥就會變質(zhì)，失去藥效，有時還會發(fā)生燃燒式爆炸事故，或造成人畜中毒事件等。因此，各種農(nóng)藥必須要專門妥善保管。